Les thèmes abordés par JOBIM couvrent le spectre de la bio-informatique
dans ses multiples composantes. Cela comprend à la fois des aspects
méthodologiques amont (modélisation mathématique, informatique,
statistique, physique) et des contributions applicatives allant
jusqu’à l’établissement de nouveaux résultats en biologie. Sans être
exhaustif, on peut citer les domaines suivants :
- génomique, génomique comparative et métagénomique
- réseaux biologiques
- modélisation des systèmes dynamiques et biologie des systèmes
- analyse de séquences, comparaison de génomes, et recherche de motifs
- structures des macromolécules
- protéomique et interactions
- ARN non-codants
- évolution et phylogénie
- expression des gènes
- haplotypes et polymorphismes (SNP)
- ontologies, bases de données, intégration de données
- algorithmique et statistiques appliquées à la bio-informatique
- epigénétique, épigénomique
- algorithmique pour le traitement de données de séquençage haut-débit
- inférence de motifs, domaines, prédiction fonctionnelle